По возвращении в Цюрих Лафатер руководил различными хоровыми коллективами, занимал пост музикдиректора Цюрихского университета. В 1923—1959 годах — директор Цюрихской музыкальной академии.
Композиторское наследие Лафатера состоит преимущественно из вокальных сочинений, тексты многих из них написаны на ретороманском языке, пропагандистом которого Лафатер выступал.