Хеландер — воспитанник клуба «Мальмё» из своего родного города. 8 сентября 2011 года в матче против «Ефле» он дебютировал в Алсвенскан лиге[3]. В 2013 году Филип стал чемпионом страны и обладателем Суперкубка Швеции. 23 августа 2014 года в поединке против «Норрчёпинга» Хеландер забил свой первый гол за «Мальмё»[4]. В 2014 году Халандер во второй раз стал чемпионом Швеции.
По окончании сезона он присоединился к «Болонье». 16 октября 2016 года в матче против «Лацио» Филип дебютировал за новый клуб[7]. В этом же поединке Хеландер забил свой первый гол за «Болонью».