В 1980-х годах Хелена состояла в фактическом браке с неким Андре. В этих отношениях Фернандес родила своего первого сына — Яна (род.1988).
В настоящее время Хелена замужем за кинорежиссёром Хосе Альваренга-младшим[порт.]. В этом браке Фернандес родила своих второго и третьего сыновей — Антонио Альваренга (род.2003) и Лукаса Альваренга (род.07.03.2004).