В 1943 году Фудзита стал директором храма Мэйдзи. С 29 августа 1944 по 3 мая 1946 года занимал должность Камергера Японии. Уйти в отставку с должности Камергера его вынудил Дуглас Макартур, ассоциировавший его с японской военной кастой[1]. Также в 1945—1946 годах исполнял обязанности министра — хранителя печати.