8 ноября 1606 года Хортледер получил степень доктора наук за «Dissertatio de vero sensu L. Non omnium» и уже через несколько дней (17 ноября) женился на Катарине Барт (1582-1639), дочери Карла Барта[нем.]; в браке у них родилась дочь Анна Катарина (1614-1657), которая впоследствии вышла замуж за Цахариаса Прюшенка фон Линденхофена[нем.][2].
С 1609 года он, как правило на латинском языке, читал лекции в университете Йены; множество работ учёного также были опубликованы на латыни.
Среди его трудов следует выделить важное для истории Германии сочинение под заглавием: «Handlungen und Ausschreiben von den Ursachen des deutschen Krieges Knig Karls V wider die Schmalkaldischen Bundes-orbiste» (до 1545 года; 2 издание — 1646)[3].
Фридрих Хортледер умер 5 июня 1640 года в городе Йене.