Команда дубля донецкого «Шахтёра» была организована в 1949 году для участия в чемпионате СССР среди дублирующих составов. В этом турнире команда провела 41 сезон.
На базе этой команды в 1992 году был организован «Шахтёр-2», который в сезоне 1992 года выступал в Первой лиге, где занял 12[1] место. В результате этого команда провела сезоны с 1992/93 по 1997/98 во Второй лиге, вновь вернувшись в Первую лигу в 1998 году. Перед началом сезона 2006/07 команда снялась с соревнований Первой лиги 2006/07 до их начала с целью участия во вновь организованном турнире дублёров, как «Шахтёр-дубль» Донецк.