6 октября 2004 года Эллинджер был назван первым главным тренером будущего клуба MLS из Солт-Лейк-Сити, начинающего выступления в сезоне 2005[4][5]. Под его руководством «Реал Солт-Лейк» выиграл 15, проиграл 37 и свёл вничью 16 матчей. 3 мая 2007 года капитан «Реал Солт-Лейк» Джейсон Крайс завершил игровую карьеру и был назначен главным тренером, Эллинджер остался в клубе на должности технического директора — директора по футбольным операциям[6][7][8]. В августе 2007 года он покинул клуб[9][10][11].
31 октября 2007 года Эллинджер занял должность технического директора Молодёжной футбольной ассоциации США[12][13].
19 июня 2008 года он вошёл в тренерский штаб клуба «Даллас» в качестве ассистента нового главного тренера Шелласа Хайндмана[14]. 15 ноября 2012 года Эллинджер объявил о завершении тренерской карьеры[15][16].
Примечания
123John Ellinger(англ.). Real Salt Lake. Дата обращения: 12 мая 2006. Архивировано из оригинала 12 мая 2006 года.