Родился в семье оленевода в посёлке Нельмин-Нос. В 1961 году окончил Ненецкую школу-интернат. В 1964 году окончил лётное училище в Кременчуге. С 1964 года второй пилот вертолета Ми-4Нарьян-Марского авиаотряда, с 1969 года командир вертолета Ми-4.
Мемориальная доска погибшему в 1973 экипажу вертолета Ми-4 на территории аэропорта Нарьян-Мар, на мемориальной стене за обелиском «Летчикам Заполярья 1941—1945».
В посёлке Нельмин Нос, в 2019 году установлен памятник Семёну Явтысому[2].
14 сентября 2025 года на аллее Полярных летчиков в Нарьян-Маре установлен бюст Семёна Явтысогоо[3].