Начинал свою карьеру в местных командах. В 2007 году уехал с родины и подписал контракт с перуанским клубом "Альянса Атлетико". Тем самым Сисей стал первым гамбийским легионером в Латинской Америке[1]. В дальнейшем выстуцпал за европейские коллективы, которые, в основном, выступали в низших лигах. Наибольших успехов хавбек добился в составе эстонского "Нымме Калью". В его составе Сисей становился чемпионом страны и участвовал в матчах отборочного этапа Лиги Чемпионов[2]. В последние годы играет в любительских командах Финляндии.
В сборной
За сборную своей страны Янкуба Сисей дебютировал 16 июня 2007 года в гостевом матче против Кабо-Верде, который завершился со счетом 0:0[3]. Всего за национальную команду хавбек провел пять игр.