Меню

Главная
Случайная статья
Настройки
28S рРНК
Материал из https://ru.wikipedia.org

28S рибосомная РНК — структурная рибосомная РНК (рРНК) большой субъединицы эукариотических цитоплазматических рибосом и, таким образом, одна из основных компонентов всех эукариотических клеток. Она имеет размер 25S у растений и 28S у млекопитающих, отсюда название 25S – 28S рРНК[1].

В сочетании с 5,8S рРНК на 5'-стороне, это эукариотический ядерный гомолог прокариотической 23S и митохондриальной 16S рибосомной РНК[2][3][4].

Содержание

Использование в филогении

Гены, кодирующие 28S рРНК, называют 28S рДНК. Сравнение последовательностей этих генов иногда используется в молекулярном анализе для построения филогенетических деревьев, например, у простейших, [5] грибов, [6] насекомых, [7] тихоходок, [8] и позвоночных[9][10].

Состав

28S рРНК имеет длину, как правило, 4000–5000 нт[11].

У некоторых эукариот 28S рРНК в рибосоме расщеплена на две части, что может[11] происходить как до сборки рибосомы, так и после сборки. На последнее указывает поверхностное расположение места разреза в одном из исследований[11][12]. Явление названо «скрытым разрывом» (hidden break)[11].

Базы данных

Несколько баз данных предоставляют выравнивания и аннотации последовательностей рРНК LSU для сравнительных целей:
  • RDP, [13] Проект базы данных рибосом; [14] [15]
  • SILVA, проект базы данных генов рибосомных РНК. [16]


Примечания
  1. Lodish, Harvey F. Molecular cell biology / Harvey F. Lodish, James E. Darnell. — Scientific American Books, 1995-01-01. — ISBN 978-0-7167-2380-6.
  2. Eperon, I. C. (31 июля 1980). Distinctive sequence of human mitochondrial ribosomal RNA genes. Nature (англ.). 286 (5772): 460–467. doi:10.1038/286460a0. PMID 6157106.
  3. 1 2 3 4
  4. Ben-Shem, A. et al. The structure of the eukaryotic ribosome at 3.0 resolution. Science. 334, 1524–1529 (2011).
  5. Ribosomal Database Project. RDP Release 11, Update 5 (30 сентября 2016). Дата обращения: 31 декабря 2016. Архивировано 19 августа 2020 года.
Downgrade Counter