Меню
Главная
Случайная статья
Настройки
|
28S рибосомная РНК — структурная рибосомная РНК (рРНК) большой субъединицы эукариотических цитоплазматических рибосом и, таким образом, одна из основных компонентов всех эукариотических клеток. Она имеет размер 25S у растений и 28S у млекопитающих, отсюда название 25S – 28S рРНК[1].
В сочетании с 5,8S рРНК на 5'-стороне, это эукариотический ядерный гомолог прокариотической 23S и митохондриальной 16S рибосомной РНК[2][3][4].
Содержание
Использование в филогении
Гены, кодирующие 28S рРНК, называют 28S рДНК. Сравнение последовательностей этих генов иногда используется в молекулярном анализе для построения филогенетических деревьев, например, у простейших, [5] грибов, [6] насекомых, [7] тихоходок, [8] и позвоночных[9][10].
Состав
28S рРНК имеет длину, как правило, 4000–5000 нт[11].
У некоторых эукариот 28S рРНК в рибосоме расщеплена на две части, что может[11] происходить как до сборки рибосомы, так и после сборки. На последнее указывает поверхностное расположение места разреза в одном из исследований[11][12]. Явление названо «скрытым разрывом» (hidden break)[11].
Базы данных
Несколько баз данных предоставляют выравнивания и аннотации последовательностей рРНК LSU для сравнительных целей:
- RDP, [13] Проект базы данных рибосом; [14] [15]
- SILVA, проект базы данных генов рибосомных РНК. [16]
Примечания
- Lodish, Harvey F. Molecular cell biology / Harvey F. Lodish, James E. Darnell. — Scientific American Books, 1995-01-01. — ISBN 978-0-7167-2380-6.
- Eperon, I. C. (31 июля 1980). Distinctive sequence of human mitochondrial ribosomal RNA genes. Nature (англ.). 286 (5772): 460–467. doi:10.1038/286460a0. PMID 6157106.
-
-
-
-
-
-
-
-
- 1 2 3 4
- Ben-Shem, A. et al. The structure of the eukaryotic ribosome at 3.0 resolution. Science. 334, 1524–1529 (2011).
- Ribosomal Database Project (неопр.). RDP Release 11, Update 5 (30 сентября 2016). Дата обращения: 31 декабря 2016. Архивировано 19 августа 2020 года.
-
-
-
|
|