• Управление, штаб (Екатеринбург), в/ч 10866;
• 76-я дивизия ПВО (Самара):
  • 764-й истребительный авиационный полк (Пермь /Большое Савино/): МиГ-31;
  • 185-й зрп (Берёзовский, Свердловская обл.), в/ч 92851;
  • 511-й гв.зрп Смоленский краснознаменный, орденов Суворова, трижды Кутузова, Богдана Хмельницкого (Энгельс, Саратовская обл.), в/ч 40218;
  • 568-й зрп Краснознамённый (Самара), в/ч 28042;
  • 1538-й гв.зрп (Челябинск);
  • 51-й ртп (Челябинск), в/ч 51946;
  • 44-я ртбр (Мирный, Самарская обл.), в/ч 40278; (или 36-я ртбр);

• • Части армейского подчинения:
• 75-я осаэ (Екатеринбург /Кольцово/): Ми-8, Ан-26;
• 118-я овэ (Чебеньки), Оренбургская обл.), в/ч 36865: Ми-6, Ми-8, Ми-14;
• 303-я овэ (Гиссар, Таджикистан), в/ч пп 62853: 4 Ми-8, 4 Ми-24;
• 316-я овэ (Троицк, Челябинская обл.), в/ч 03602: Ми-6, Ми-8;
• 320-я отаэ псс (Упрун, Челябинская обл.), в/ч 27834: Ан-12, Ан-24;

• 1-й огв.бап Красногвардейский ордена Ленина, дважды Краснознамённый (Лебяжье, Волгоградская обл.): Су-24, (передан 1.06.2001г. из МО ВВС и ПВО);
• 2881-я центральная база резерва вертолётов (Тоцкое-2, Оренбургская обл.);
• 4215-я база резерва самолётов (Чебеньки, Оренбургская обл.);
• Авиакомендатура (Самара /Кряж/);

В октябре 2002 года к имеющимся частям из Сухопутных войск переданы вертолетные части:

• 793-й отбвп (Кинель-Черкассы, Самарская обл.), в/ч 62977: Ми-8, Ми-26;
• 237-я овэ (Бобровка, Самарская обл.), в/ч 34395: Ми-8, Ми-24;
• 199-я овэ (Троицк, Челябинская обл.), в/ч 26110: Ми-8, Ми-24;

В 2002 году сформирована и вошла в состав армии 999-я АвБ (Кант, Киргизия), в/ч пп 20022: 2 Ми-8мтв, 2 Л-39, 5 Су-25;

В декабре 2003 года сформированы:

• 30-я авиационная база на аэродроме Екатеринбург /Кольцово/, (на базе 75-й осаэ);
• 80-я авиационная база на аэродроме Упрун, (на базе 320-й отаэ псс);
• 933-я авиационная база на аэродроме Троицк, (на базе 199-й овэ, 316-й овэ).

В 2007 году 303-я овэ передислоцирована в аэропорт Душанбе.

В декабре 2007 года 118-я овэ вошла как вэ в состав 80-й АвБ.