Родился 1 января 1787 года и происходил из древнего дворянского рода Лифляндской губернии; двоюродный брат Вильгельма Иоганна Энгельбрехта фон Цёккеля. Получив высшее образование на юридическом факультете Дерптского университета[1], Александр Вильгельм Иоганн фон Цёкелль поступил в военную службу.
В чине инженер-майора фон Цёкелль вышел в отставку и получил доцентуру в Дерптском университете[2]; в то же время был советником Правления Лифляндского кредитного общества.