Гимар покинул свой пост в 1998 году, новым генеральным директором стал Ален Бондю, а Бернар Кильфен новым менеджером.
В 1999 году бразды правления командой принимает Ален Делёэль. В 2002 году Франсис Ван Лондерсель, бывший заместитель Делёэля, стал спортивным директором.
В 2004 году за Cofidis выступали три действующих чемпиона мира: Игорь Астарлоа — чемпион мира в групповой гонке, Дэвид Миллар — в гонке с раздельно старта и Лоран Гане — на треке. В том же году велогруппа оказалась замешана в допинг-скандале[2]. Миллар впоследствии был уволен[3].
25 июля2007 года велогонщик Кристиан Морени не прошёл допинг тест после 11-го этапа Тур де Франс. В его крови били обнаружены следы тестостерона. Команда снялась с участия в туре[4][5].