Родился 22 мая 1881 года в Лиможе. Учился в Страсбургской высшей школе фармации и в Сорбонне, последовательно получил диплом фармацевта, степень лиценциата естественных наук и доктора естественных наук. С 1904 года работал ассистентом по криптогамическим организмам на факультете фармации Парижского университета.
С 1913 года читал курс химической фармации в Высшей школе фармации Нанси, с 1914 года — также курсы гидробиологии и микробиологии.
В 1919 году Сартори был назначен профессором бактериологии и криптогамии Высшей школы фармации Страсбургского университета. В 1936 году стал деканом Высшей школы.
С 1947 года являлся профессором микробиологии и фармации в Париже.
Meyer J. In memoriam Auguste Sartory (1881–1950) : [фр.]. — Mycopathologia et Mycologia Applicata. — 1957. — Vol. 8 (3). — P. 239—242. — doi:10.1007/BF02052835.