Меню
Главная
Случайная статья
Настройки
|
Verrucomicrobia (лат., от лат. verruca — бугорок) — тип бактерий, к которому относятся в основном некультивируемые формы[2]. Как указывают метагеномные данные, в природе они распространены исключительно широко[2]. Они составляют от 1 до 10 % почвенной микробиоты и потому имеют важное экологическое значение[3].
Содержание
Описание
Представители Verrucomicrobia — грамотрицательные бактерии, у многих из которых на поверхности имеются простеки (бугорки), за что тип и получил своё название. Клетки — палочковидные, овоидные, одиночные или в парах, веретеновидные. У Prosthecobacter[англ.] на одном из конце клетки имеется уникальное бульбовидное утолщение. По типу питания Verrucomicrobia — хемоорганогетеротрофы и сбраживают разнообразные сахара[4]. Некоторые представители способны окислять метан при экстремально низких значениях рН[5][6].
Среди Verrucomicrobia есть анаэробы, факультативные анаэробы и аэробы; лучше всего представители филы растут при температуре 25 °C и pH от 4 до 7. Помимо почв, встречаются в пресноводных водоёмах, пелагиали и желудочно-кишечном тракте человека[4].
Систематика
По данным филогенетического анализа, ближайшими родственниками Verrumicrobia являются представители типа Chlamydiae[англ.][7]. В 2008 году был секвенирован и опубликован геном одного из представителей типа, Methylacidiphilum infernorum[англ.]. Его анализ указал на возможное родство Verrumicrobia и протеобактерий[8].
Филогения
Ниже представлено филогенетическое дерево Verrumicrobia, построенное по последовательностям 16S рРНК в рамках проекта The All-Species Living Tree[англ.].
Классификация
На декабрь 2017 года в тип включают следующие таксоны до рода включительно[9]:
Примечания
- Hedlund B. P., Gosink J. J., Staley J. T. Verrucomicrobia div. nov., a new division of the bacteria containing three new species of Prosthecobacter. (англ.) // Antonie Van Leeuwenhoek. — 1997. — July (vol. 72, no. 1). — P. 29—38. — PMID 9296261.
- 1 2 Li Zhang, Zhihong Xu. Assessing bacterial diversity in soil (англ.) // Journal of Soils and Sediments. — 2008-12-01. — Vol. 8, iss. 6. — P. 379–388. — ISSN 1614-7480. — doi:10.1007/s11368-008-0043-z.
- Пиневич, 2006, с. 127—128.
- 1 2 Пиневич, 2006, с. 128.
- Pol Arjan, Heijmans Klaas, Harhangi Harry R., Tedesco Dario, Jetten Mike S. M., Op Den Camp Huub J. M. Methanotrophy below pH1 by a new Verrucomicrobia species // Nature. — 2007. — Vol. 450. — P. 874—878. — ISSN 0028-0836. — doi:10.1038/nature06222.
- Dunfield P. F., Yuryev A., Senin P., Smirnova A. V., Stott M. B., Hou S., Ly B., Saw J. H., Zhou Z., Ren Y., Wang J., Mountain B. W., Crowe M. A., Weatherby T. M., Bodelier P. L., Liesack W., Feng L., Wang L., Alam M. Methane oxidation by an extremely acidophilic bacterium of the phylum Verrucomicrobia. (англ.) // Nature. — 2007. — Vol. 450, no. 7171. — P. 879—882. — doi:10.1038/nature06411. — PMID 18004300.
- Griffiths E., Gupta R. S. Phylogeny and shared conserved inserts in proteins provide evidence that Verrucomicrobia are the closest known free-living relatives of chlamydiae. (англ.) // Microbiology (Reading, England). — 2007. — August (vol. 153, no. Pt 8). — P. 2648—2654. — doi:10.1099/mic.0.2007/009118-0. — PMID 17660429.
- Hou S., Makarova K. S., Saw J. H., Senin P., Ly B. V., Zhou Z., Ren Y., Wang J., Galperin M. Y., Omelchenko M. V., Wolf Y. I., Yutin N., Koonin E. V., Stott M. B., Mountain B. W., Crowe M. A., Smirnova A. V., Dunfield P. F., Feng L., Wang L., Alam M. Complete genome sequence of the extremely acidophilic methanotroph isolate V4, Methylacidiphilum infernorum, a representative of the bacterial phylum Verrucomicrobia. (англ.) // Biology Direct. — 2008. — 1 July (vol. 3). — P. 26—26. — doi:10.1186/1745-6150-3-26. — PMID 18593465.
- Classification of domains and phyla - Hierarchical classification of prokaryotes (bacteria) : Version 2.0 : [англ.] // LPSN. — 2016. — 2 October.
Литература- Пиневич А. В. Микробиология. Биология прокариотов: в 3 т. — СПб.: Издательство С.-Петербургского университета, 2006. — ISBN 5-288-04056-7.
|
|