2 февраля 1916 года Святой Престол учредил апостольский викариат Сан-Педро-Сулы, выделив его из епархии Комаягуа. В этот же день апостольский викариат Сн-Педро-Сулы вошёл в митрополию Тегусигальры.
6 июля 1963 года Римский папаПавел VI издал буллу«Sedis Apostolicae», которой преобразовал апостольский викариат Сан-Педро-Сулы в епархию.
3 июля 1987 года и 30 декабря 2011 года епархия Сан-Педро-Сулы передала часть своей территории для возведения новых епархий Трухильо и Ла-Сейбы.