Сесар Вильянуэва родился в августе 1946 года в провинции Сан-Мартин в её самом крупном городе Тарапото. Там же окончил школу. Учился в столице страны Лиме в Национальном университете им. Федерико Виллареала.
В конце февраля 2014 года в кабинете министров Перу произошёл скандал. Вильянуэва по этой причине 25 февраля оставил пост главы правительства страны[4]. Сменил его на этом посту бывший министр по делам жилищного строительства Рене Корнехо[5].
В начале 2018 года в Перу разгорелся крупнейший политический скандал вызванный тем, что президент помиловал бывшего президента Альберто Фухимори. Это стало причиной отставке в марте действующего президента Педро Пабло Кучински[6][7]. Его сменил Мартин Вискарра, который в начале апреля вернул на пост премьер-министра страны Вильянуэву. Это было вызвано тем, что тогдашняя глава правительства Мерседес Араос заняла пост вице-президента страны.
Но Сесар чуть менее года занимал этот пост и был отправлен в отставку в марте 2019 года[8] .