Ондрашек начал профессиональную карьеру в клубе «Динамо» из Ческе-Будеёвице. В 2007 году он дебютировал в Гамбинус-лиге. В 2009 году Ондрашек на правах аренды выступал за «Часлав». После окончания аренды он вернулся в «Динамо». 2 августа 2009 года в поединке против «Богемианс 1905» Зденек забил свой первый гол за клуб[4]. В 2012 году Ондрашек на правах аренды перешёл в норвежский «Тромсё». 25 марта в матче против «Фредрикстад» он дебютировал в Типпелиге[5]. В этом же поединке Зденек забил свой первый гол за «Тромсё». По окончании аренды он подписал с клубом постоянный контракт. В 2012 году Зденек вместе с Петаром Ковашчем стал лучшим бомбардиром чемпионата, забив 14 мячей.
В начале 2016 года Ондрашек перешёл в краковскую «Вислу». 12 февраля в матче против «Шлёнска» он дебютировал в польской Экстраклассе[6]. 27 февраля в поединке против «Подбескидзе» Зденек забил свой первый гол за «Вислу»[7].
18 декабря 2018 года Ондрашек перешёл в американский «Даллас»[8]. 23 марта 2019 года в матче против «Колорадо Рэпидз» он дебютировал в MLS[9]. 17 августа 2019 года в поединке против «Монреаль Импакт» Зденек забил свой первый гол за «Даллас»[10].
13 сентября 2020 года подписал контракт с «Викторией». Он принял решение вернуться в Чехию по семейным обстоятельствам[11].
.svg){kind=link}
