Организовал в Новгороде приюты для сирот и вдов. Для защиты своей паствы от притязаний Москвы он ездил к Ивану III и убедил его «тихими очами взирать» на Новгород. В 1466 году в Новгородской земле умерло от моровой язвы более 250 000 человек, в том числе в самом Новгороде около 50 000 (среди них 7650 монашествующих и 300 священников). По сказанию летописи, Иона прекратил болезнь, совершив крестный ход в Зверин монастырь.
На Макарьевском соборе1549 года был причислен к лику общерусских святых. Мощи его находились в Предтеченском храме Отенской пустыни, не засыпанные землёй. В жизнеописаниях его рассказывается о многих чудесных исцелениях, бывших у его гроба. В начале XIX века захоронение святителя Ионы после постройки нового монастырского собора оказалось между Трёхсвятительским и Ионинским приделами и было отмечено в 1803 году позолоченной ракой и сенью. В Великую Отечественную войну храм был разрушен. Место, где под спудом находятся мощи святителя Ионы, отмечено деревянным крестом, к нему местные жители в Ильинскую пятницу свершают паломничества.
Св. Иона Отенский, архиепископ Новгородский, послед. четверть XV в.; Камка, холст, золотные, серебряные и шелковые нити[2]
