Перейра воспитанник клуба «Крус Асуль». С 2008 по 2011 году он выступал за фарм-клуб «Крус Асуль Идальго». 4 августа 2011 года в матче против «Пачуки» он дебютировал в мексиканской Примере[4]. 5 февраля 2012 года в поединке против «Хагуарес Чьяпас» Перейра забил свой первый гол за клуб[5]. В том же сезоне Хайр помог команде занять второе место в чемпионате.
В начале 2014 года Перейра перешёл в «Гвадалахару». 13 января в матче против «Хагуарес Чьяпас» он дебютировал за новый клуб[6]. 27 октября в поединке против «Тихуаны» Хайр забил свой первый гол за «Гвадалахару»[7]. В 2017 году он помог клубу выиграть чемпионат. В 2018 году Перейра стал победителем Лиги чемпионов КОНКАКАФ.