Начал свою карьеру в Злине. Один сезон сыграл за клуб из Всетина. В 2008 году уехал за океан в клуб Sault Ste. Marie Greyhounds, который состоит в ОХЛ. После двух лет в Канаде Томаш вернулся в Чехию. В данный момент является игроком пражского Льва, выступающего в Континентальной хоккейный лиге. В дебютном сезоне КХЛ Томаш сыграл за Лев 40 матчей записал на свой счёт 15 очков и заработав 22 минуты штрафа. В 2013 году вызывался в сборную Чехии для выступления на Еврохоккейтуре. В сезоне КХЛ 2012/2013 2 раза признавался лучшим новичком недели.[1][2]
Сезон 2019/2020 начал очень удачно, был 2-м бомбардиром Экстралиги. В ноябре 2019 года Милош Ржига вызвал Томаша Рахунека в сборную Чехии после долгого перерыва[3].