Впервые бактерии этого семейства описаны Альбертом Клюйвером и Корнелиусом Ван Нилем в 1936 году. В 1981 году Балхом и Вольфе род Methanococcus выделен в отдельное семейство Methanococcaceae, а в 2002 году Витманом обнаружен второй род Methanothermococcus[1].
На июнь 2017 года в семейство включают два рода[2]:
MethanococcusKluyver and van Niel 1936 emend. Barker 1936 emend. Mah and Kuhn 1984typus (5 видов)