Меню

Главная
Случайная статья
Настройки
XbaI
Материал из https://ru.wikipedia.org

XbaI - эндонуклеаза рестрикции, выделенна из бактерии Xanthomonas badrii [1].

Свойства

XbaI относится к эндонуклеазам рестрикции (Тип II, подтип P). То есть XbaI распознает палиндромную последовательность ДНК и осуществляет рестрикцию внутри палиндрома в фиксированной точке. В присутствии диметилсульфоксида (ДМСО) и при высоких концентрациях глицерина в среде XbaI теряет способность распознавать палиндром и осуществляет неспецифическую рестрикцию (звёздная активность) [источник не указан 2791 день]. После рестрикции образуются липкие концы с выступами из четырёх оснований.
Пример палиндромной последовательности, распознаваемой XbaI и образующиеся после рестрикции продукты
Палиндромный участок Продукты рестрикции 
5'-TCTAGA-3'
3'-AGATCT-5'

5'-T       CTAGA-3'
3'-AGATC       T-5'


XbaI рестриктазная активность ингибируется при метилировании аденина (DAM метилаза). Однако, рестриктазная активность сохраняется при метилировании цитозина (DCM- или CpG-метилазы)

После завершения рестрикции ДНК, XbaI может быть инактивирована денатурацией нагреванием до 65°C в течение 20 минут

Применение

XbaI широко используется в молекулярно-биологических исследованиях. В частность XbaI применяется при клонировании специфических нуклеотидных последовательностей [2], при рестрикционном анализе.

Так например, XbaI использовалась при анализе полиморфизма рецептора эстрогена [3]  и липопротеина а (ApoB)[4].

Ссылки
  1. Biolabs, New England. XbaI | NEB. www.neb.com. Дата обращения: 8 мая 2016. Архивировано 3 февраля 2022 года.
  2. Principles and techniques of biochemistry and molecular biology. — 7th ed. — Cambridge, UK: Cambridge University Press, 2010. — xvi, 744 pages с. — ISBN 9780521516358.
  3. Hong Weng, Chao Zhang, Yuan-Yuan Hu, Rui-Xia Yuan, Hong-Xia Zuo. Association between Estrogen Receptor-Gene XbaI and PvuII Polymorphisms and Periodontitis Susceptibility: A Meta-Analysis (англ.) // Disease Markers. — 2015. — Vol. 2015. — P. 1–9. — ISSN 0278-0240. — doi:10.1155/2015/741972. Архивировано 12 января 2018 года.
  4. Wei Gu, Mingduo Zhang, Shaojun Wen. Association between the APOB XbaI and EcoRI polymorphisms and lipids in Chinese: a meta-analysis (англ.) // Lipids in Health and Disease. — 2015/12. — Т. 14, вып. 1. — С. 123. — ISSN 1476-511X. — doi:10.1186/s12944-015-0125-z. Архивировано 12 января 2018 года.
Downgrade Counter