Меню

Главная
Случайная статья
Настройки
MiR-16
Материал из https://ru.wikipedia.org

MiR-16 — это cемейство предшественников микроРНК, представляет собой группу родственных небольших некодирующих генов РНК, которые регулируют экспрессию генов . miR-16, miR-15, mir-195 и miR-497 являются родственными последовательностями-предшественниками микроРНК из семейства генов mir-15[1]. Это семейство микроРНК, по-видимому, специфично для позвоночных, и его члены были предсказаны или экспериментально подтверждены для широкого круга видов позвоночных[2].

Содержание

История изучения

Человеческий предшественник miR-16 был обнаружен Калином и его коллегами с помощью подробного профиля экспрессии и анализа кариотипа пациентов[3]. Кариотипирование хромосомных структур у людей с B-клеточной хронической лимфоцитарной лейкемией (B-CLL) показало, что более чем у половины есть изменения в области 13q14.[4] Делеции этой хорошо охарактеризованной 1 мегабазной области генома[5][6] также наблюдались примерно в 50 % лимфом из мантийных клеток, до 40 % множественной миеломы, и 60 % случаев рака простаты .[7] Всесторонний скрининг региона в то время не предоставил убедительных доказательств участия какого-либо из известных на то время генов.[8][9][10][11][12] Используя CD5 + B-лимфоциты[13] которые, как известно, накапливаются с прогрессированием B-CLL, минимальная область, потерянная из области 13q14, была тщательно исследована на предмет регуляторных элементов . Общедоступные базы данных последовательностей были использованы для идентификации кластера гена, который кодирует гомолог к человеку miR15 и miR16 от Элеганса Caenorhabditis .[14][15][16]

Генные мишени

В оригинальной публикации, которая идентифицировала действие miR15 и miR16 в развитии B-CLL, Calin и др. Предположили, что miR16 может быть мишенью с несовершенным спариванием оснований для 14 генов[3]. Увеличение количества CD5 + B-лимфоцитов при ХЛЛ предполагает, что miR16 может участвовать в клеточной дифференцировке . В моделях на животных одноцепочечные виды микроРНК действуют путем связывания с несовершенными комплементами мРНК, обычно с 3 'UTR,[17][18] хотя мишени также наблюдались в кодирующей последовательности мРНК .[19] Подавление miR16 (а также miR15) наблюдали в диффузной большой B-клеточной лимфоме[20]. miR16, как было показано, связывается с парой из девяти оснований с комплементарной последовательностью в 3'-UTR области BCL2, которая является антиапоптотическим геном, участвующим в эволюционно консервативном пути запрограммированной гибели клеток .[21] Было показано, что в линии клеток карциномы носоглотки miR-16 нацелен на 3'-UTR фактора роста эндотелия сосудов (VEGF) и подавляет экспрессию VEGF, который является важным ангиогенным фактором.[22][23]

Клиническая значимость

Изменённая экспрессия микроРНК-16 наблюдалась при раке[24][25][26] включая злокачественные новообразования груди,[27] толстой кишки[28][29] , мозга[30][31] , легких[32] , лимфатической системы[3][20][33][34] , яичников[35] , поджелудочной железы[36] , простаты[37] и желудка .[38] Эта разница в уровнях экспрессии может использоваться для различения злокачественных и здоровых тканей и для определения клинического прогноза .[39][40] Тот факт, что патология связана с другим профилем экспрессии, привел к предположению, что специфические биомаркеры заболевания могут служить потенциальными мишенями для направленного клинического вмешательства.[41] Совсем недавно появились доказательства того, что при колоректальном раке эффективность лечения моноклональным антителом цетуксимабом можно оценить по типу экспрессии колоректальной карциномы после терапии .[42]

miR-16 и miR-15a сгруппированы в области 0,5 т.п.н. в хромосоме 13 (13q14) у человека, хромосомной области, которая, как было показано, удалена или подавлена примерно в более чем половине B-CLL[3], наиболее распространенной. форма лейкемии у взрослых.[43] Канцерогенез — это постепенный процесс, включающий множество генетических мутаций, поэтому у каждого пациента со злокачественными новообразованиями присутствует гетерогенная популяция клеток . Тот факт, что потеря микро РНК mir-16 наблюдается в большой части клеток, указывает на изменение, произошедшее на ранней стадии развития[25] и на цель терапевтического вмешательства.

Примечания
  1. miRNA gene family: mir-15 (168 sequences). Дата обращения: 7 июля 2021. Архивировано 9 июля 2021 года.
  2. MIPF0000006. Дата обращения: 7 июля 2021. Архивировано 23 декабря 2012 года.
  3. 1 2 3 4 Frequent deletions and down-regulation of micro-RNA genes miR15 and miR16 at 13q14 in chronic lymphocytic leukemia. Proc Natl Acad Sci USA. 99 (24): 15524–15529. 2002. doi:10.1073/pnas.242606799. PMID 12434020.
  17. Conserved seed pairing, often flanked by adenosines, indicates that thousands of human genes are microRNA targets. Cell. 120 (1): 15–20. 2005. doi:10.1016/j.cell.2004.12.035. PMID 15652477.
  18. Systematic discovery of regulatory motifs in human promoters and 3' UTRs by comparison of several mammals. Nature. 434 (7031): 338–345. 2005. doi:10.1038/nature03441. PMID 15735639.
  19. MicroRNAs to Nanog, Oct4 and Sox2 coding regions modulate embryonic stem cell differentiation. Nature. 455 (7216): 1124–1128. 2008. doi:10.1038/nature07299. PMID 18806776.
  20. 1 2 Accumulation of miR-155 and BIC RNA in human B-cell lymphoma. Proc Natl Acad Sci U S A. 102 (10): 3627–3632. 2004. doi:10.1073/pnas.0500613102. PMID 15738415.
  21. miR-15 and miR-16 induce apoptosis by targeting BCL2. Proc Natl Acad Sci U S A. 102 (39): 13944–13949. 2005. doi:10.1073/pnas.0506654102. PMID 16166262.
  22. MiRNA-directed regulation of VEGF and other angiogenic factors under hypoxia. PLOS One. 1 (1): e116. 27 декабря 2006. doi:10.1371/journal.pone.0000116. PMID 17205120.{{cite journal}}: Википедия:Обслуживание CS1 (не помеченный открытым DOI) (ссылка)
  23. The effect of central loops in miRNA:MRE duplexes on the efficiency of miRNA-mediated gene regulation. PLOS One. 3 (3): e1719. 5 марта 2008. doi:10.1371/journal.pone.0001719. PMID 18320040.{{cite journal}}: Википедия:Обслуживание CS1 (не помеченный открытым DOI) (ссылка)
  24. MicroRNA expression profiles classify human cancers. Nature. 435 (7043): 834–838. 2005. doi:10.1038/nature03702. PMID 15944708.
  25. 1 2 Croce CM. (2009). Causes and consequences of microRNA dysregulation in cancer. Nat Rev Genet. 10 (10): 704–714. doi:10.1038/nrg2634. PMID 19763153.
  26. Human microRNA genes are frequently located at fragile sites and genomic regions involved in cancers. Proc Natl Acad Sci U S A. 101 (9): 2999–3004. 2004. doi:10.1073/pnas.0307323101. PMID 14973191.
  27. Downregulation of the tumor-suppressor miR-16 via progestin-mediated oncogenic signaling contributes to breast cancer development. Breast Cancer Res. 14 (3): R77. 2012. doi:10.1186/bcr3187. PMID 22583478.{{cite journal}}: Википедия:Обслуживание CS1 (не помеченный открытым DOI) (ссылка)
  28. Reduced accumulation of specific microRNAs in colorectal neoplasia. Mol Cancer Res. 1 (12): 882–891. 2003. PMID 14573789. Архивировано 12 июля 2021. Дата обращения: 7 июля 2021.
  29. MicroRNA expression profiles associated with prognosis and therapeutic outcome in colon adenocarcinoma. JAMA. 299 (4): 425–436. 2008. doi:10.1001/jama.299.4.425. PMID 18230780.
  30. Extensive modulation of a set of microRNAs in primary glioblastoma. Biochem Biophys Res Commun. 334 (4): 1351–1358. 2005. doi:10.1016/j.bbrc.2005.07.030. PMID 16039986.
  31. MicroRNA-21 is an antiapoptotic factor in human glioblastoma cells. Cancer Res. 65 (14): 6029–6033. 2007. doi:10.1158/0008-5472.CAN-05-0137. PMID 16024602. Архивировано 26 марта 2015. Дата обращения: 7 июля 2021.
  32. Reduced expression of the let-7 microRNAs in human lung cancers in association with shortened postoperative survival. Cancer Res. 64 (11): 3753–3756. 2004. doi:10.1158/0008-5472.CAN-04-0637. PMID 15172979. Архивировано 9 июля 2014. Дата обращения: 7 июля 2021.
  33. High expression of precursor microRNA-155/BIC RNA in children with Burkitt's lymphoma. Genes Chromosomes Cancer. 39 (2): 167–169. 2004. doi:10.1002/gcc.10316. PMID 14695998.
  34. Identification and characterization of a novel gene, C13orf25, as a target for 13q31-q32 amplification in malignant Lymphoma. Cancer Res. 64 (9): 3087–3095. 2004. doi:10.1158/0008-5472.CAN-03-3773. PMID 15126345. Архивировано 14 апреля 2016. Дата обращения: 7 июля 2021.
  35. MicroRNA signatures in human ovarian cancer. Cancer Res. 67 (8): 8699–8707. 2007. doi:10.1158/0008-5472.CAN-07-1936. PMID 17875710. Архивировано 14 августа 2016. Дата обращения: 7 июля 2021.
  36. MicroRNA expression patterns to differentiate pancreatic adenocarcinoma from normal pancreas and chronic pancreatitis. JAMA. 297 (17): 1901–1908. 2007. doi:10.1001/jama.297.17.1901. PMID 17473300.
  37. The miR-15a-miR-16-1 cluster controls prostate cancer by targeting multiple oncogenic activities. Nat Med. 14 (11): 1271–1277. 2008. doi:10.1038/nm.1880. PMID 18931683.
  38. MicroRNA signatures in human ovarian cancer. Cancer Cell. 13 (3): 272–286. 2008. doi:10.1016/j.ccr.2008.02.013. PMID 18328430.
  39. Unique microRNA molecular profiles in lung cancer diagnosis and prognosis. Cancer Cell. 9 (3): 189–198. 2006. doi:10.1016/j.ccr.2006.01.025. PMID 16530703.
  40. A MicroRNA signature associated with prognosis and progression in chronic lymphocytic leukemia. N Engl J Med. 353 (17): 1793–1801. 2005. doi:10.1056/NEJMoa050995. PMID 16251535.
  41. Cho WC. (2010). A MicroRNA signature associated with prognosis and progression in chronic lymphocytic leukemia. Expert Opin Ther Targets. 14 (10): 1005–1008. doi:10.1517/14728222.2010.522399. PMID 20854177.
  42. Specific alterations of microRNA transcriptome and global network structure in colorectal carcinoma after cetuximab treatment. Mol Cancer Ther. 14 (10): 1005–1008. 2010. doi:10.1158/1535-7163.MCT-10-0137. PMID 20881268. Архивировано 25 октября 2018. Дата обращения: 7 июля 2021.
  43. Dhner H (2000). Genomic Aberrations and Survival in Chronic Lymphocytic Leukemia. N Engl J Med. 343 (26): 1910–1916. doi:10.1056/NEJM200012283432602. PMID 11136261.
Downgrade Counter