Он был профессором ботаники на Факультете естественных наук, Масариков университет, Брно, а также был основателем ботанического сада и организатором ботанических исследований в Моравии.
В 1909 году Подпера был назначен куратором Моравского музея в Брно. В 1912 году он стал директором отдела ботаники в коллекции музея.